home *** CD-ROM | disk | FTP | other *** search
/ Shareware Overload Trio 2 / Shareware Overload Trio Volume 2 (Chestnut CD-ROM).ISO / dir26 / med9410p.zip / M94A3272.TXT < prev    next >
Text File  |  1994-10-25  |  3KB  |  42 lines
  1.        Document 3272
  2.  DOCN  M94A3272
  3.  TI    Analysis of HIV-1 nef gene sequences directly isolated from infected
  4.        individuals.
  5.  DT    9412
  6.  AU    Kim SH; Kang MR; Lee MH; Huh JE; Shin Y; Kim DG; Kim TG; Cho MH; Kim S;
  7.        Seoul National University, Korea.
  8.  SO    Int Conf AIDS. 1994 Aug 7-12;10(1):114 (abstract no. PA0076). Unique
  9.        Identifier : AIDSLINE ICA10/94369303
  10.  AB    The nef gene is located near the 3' end of the HIV genome and overlaps
  11.        the 3' long terminal repeat. Although the term nef is the acronym of
  12.        negative factor, the proposed negative role of the nef gene has been
  13.        challenged by us and others. It was recently reported that in rhesus
  14.        monkeys, the nef gene of SIV is required for maintaining high virus
  15.        loads and also for development of AIDS. Almost all HIV-1 strains used
  16.        for studies on nef in the published works have been isolated in vitro by
  17.        propagating virus in peripheral blood mononuclear cells or human
  18.        CD4-positive cell lines. Therefore, these viruses may not contain the
  19.        nef gene actually present in vivo. As one approach to understand the
  20.        function of HIV-1 nef, we have been characterizing the nucleotide and
  21.        corresponding protein sequences of nef genes directly isolated from
  22.        infected individuals. The entire nef gene from 10 infected individuals
  23.        in Korea was amplified by polymerase chain reaction, cloned, and
  24.        sequenced. Our initial analysis showed that at the nucleotide level, the
  25.        intraindividual variation ranged from 0 to 3% in most cases, while the
  26.        interindividual variation was 2 to 20%. It appeared that the nef
  27.        sequences from several infected individuals were closely related. Our
  28.        results suggested that nucleotide sequences of nef from different
  29.        individuals were highly variable, enough to distinguish between strains.
  30.        We are currently studying implicaitons of these data for pathogenesis
  31.        and epidemiology of HIV in Korea.
  32.  DE    Animal  Base Sequence  *Genes, nef  Human  HIV
  33.        Infections/EPIDEMIOLOGY/ETIOLOGY/*MICROBIOLOGY
  34.        HIV-1/*GENETICS/*ISOLATION & PURIF  Korea/EPIDEMIOLOGY  Macaca mulatta
  35.        Polymerase Chain Reaction  Sequence Homology, Nucleic Acid  Simian
  36.        Acquired Immunodeficiency Syndrome/MICROBIOLOGY  SIV/GENETICS  Variation
  37.        (Genetics)  MEETING ABSTRACT
  38.  
  39.        SOURCE: National Library of Medicine.  NOTICE: This material may be
  40.        protected by Copyright Law (Title 17, U.S.Code).
  41.  
  42.